Tenía 74 años y era senador nacional desde diciembre de 2023, cuando asumió su banca por La Libertad Avanza.
Presidía la Comisión de Acuerdos, encargada del tratamiento de las postulaciones para cargos judiciales, y también la Comisión de Justicia y Asuntos Penales.
Su última actividad pública registrada fue la sesión del 24 de septiembre donde se aprobó la reforma de la Carta Orgánica del Banco Central.
“Lamento profundamente el fallecimiento de nuestro senador Juan Carlos Pagotto, un luchador de la libertad de La Rioja y nuestra país. Un cálida abrazo a su familia y seres queridos en este difícil momento”, expresó la secretario general de la Presidencia, Karina Milei, en una publicación en X.